MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015578	A	6	6	100	105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015578	TA	3	6	153	158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015578	AT	3	6	223	228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015578	T	9	9	230	238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015578	AT	3	6	246	251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015578	ATA	2	6	267	272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015578	TAA	2	6	276	281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015578	TTA	2	6	1748	1753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015578	G	6	6	5983	5988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015578	GGTATA	2	12	7662	7673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015578	TTTG	2	8	7699	7706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015578	TAA	2	6	7735	7740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015578	T	7	7	7747	7753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015578	AGG	2	6	10334	10339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015578	T	6	6	11298	11303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015578	AG	4	8	11311	11318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015578	TAT	2	6	12357	12362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015578	TAAT	2	8	12416	12423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015578	AGG	2	6	13754	13759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015578	ATC	2	6	20132	20137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015578	TAAT	2	8	20152	20159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015578	T	7	7	21379	21385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015578	TAG	2	6	21449	21454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015578	AGG	2	6	21463	21468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015578	TTG	2	6	28394	28399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015578	ATT	2	6	28403	28408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015578	TAA	2	6	28452	28457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015578	ATA	3	9	28465	28473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015578	AG	3	6	29423	29428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015578	AAACG	2	10	29429	29438	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015578	CCT	2	6	34162	34167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015578	CCG	2	6	34235	34240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015578	TCC	2	6	41561	41566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015578	TAAATA	2	12	41595	41606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015578	ACT	2	6	41671	41676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015578	TA	3	6	49605	49610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015578	TA	3	6	49616	49621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015578	TTC	2	6	49641	49646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015578	T	6	6	49696	49701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015578	CCG	2	6	49723	49728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015578	ATT	2	6	50492	50497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015578	ATA	2	6	50514	50519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015578	TA	3	6	51577	51582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015578	TAA	2	6	51620	51625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015578	AAT	2	6	51630	51635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015578	GAT	2	6	51655	51660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015578	GAA	2	6	53841	53846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015578	GGTC	2	8	53847	53854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015578	TG	3	6	53897	53902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015578	T	6	6	53913	53918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015578	AAAGC	2	10	53924	53933	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015578	GCC	2	6	53942	53947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015578	CCG	2	6	53969	53974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015578	ATT	2	6	53986	53991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015578	TAT	2	6	58429	58434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015578	ATTTT	2	10	58439	58448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015578	T	8	8	58445	58452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015578	TA	3	6	58463	58468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015578	ATT	2	6	58484	58489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015578	AAC	2	6	58493	58498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015578	CGGAA	2	10	61778	61787	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015578	CGC	2	6	61795	61800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015578	TCC	2	6	63148	63153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015578	AT	3	6	63157	63162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015578	ATC	2	6	63176	63181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015578	AAG	2	6	63252	63257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015578	T	6	6	64579	64584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015578	GAT	2	6	64637	64642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015578	GCA	2	6	66340	66345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015578	TTTG	2	8	66413	66420	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015578	TAGG	2	8	66434	66441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015578	TAT	2	6	66475	66480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015578	GCA	2	6	66500	66505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015578	AT	3	6	68841	68846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015578	AC	3	6	68894	68899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015578	TA	3	6	68903	68908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015578	ATA	2	6	68913	68918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015578	GGT	2	6	68924	68929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015578	TAA	3	9	69813	69821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015578	CAA	2	6	69825	69830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015578	TG	3	6	69839	69844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015578	ATA	2	6	73043	73048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015578	GAT	2	6	73079	73084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015578	A	6	6	73091	73096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015578	ATT	2	6	73119	73124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015578	TAA	2	6	73163	73168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015578	CAA	2	6	73235	73240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015578	ATT	2	6	73320	73325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015578	ATT	2	6	73391	73396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015578	ATT	2	6	73409	73414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015578	TG	3	6	73487	73492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015578	AT	3	6	73511	73516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015578	AAAT	2	8	73522	73529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015578	ATT	2	6	73636	73641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015578	ATTTA	2	10	73664	73673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015578	ATTAT	2	10	73713	73722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015578	GT	3	6	73752	73757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015578	AT	3	6	73773	73778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015578	GCT	2	6	73807	73812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015578	AT	4	8	73837	73844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015578	CTT	2	6	73852	73857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015578	ATA	2	6	73863	73868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015578	TGG	2	6	73960	73965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015578	A	8	8	73978	73985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015578	AAGTT	2	10	77169	77178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015578	TTAA	2	8	77185	77192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015578	ATA	2	6	77205	77210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015578	A	7	7	78391	78397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015578	GAT	2	6	78580	78585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015578	A	6	6	78594	78599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015578	A	6	6	78624	78629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015578	ATA	2	6	78693	78698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015578	ATT	2	6	78811	78816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015578	TG	3	6	78837	78842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015578	GAA	2	6	78858	78863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015578	AGA	2	6	78918	78923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015578	AAT	2	6	78940	78945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015578	TCG	2	6	79077	79082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015578	AT	4	8	80121	80128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015578	TA	3	6	82067	82072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015578	AGA	2	6	82093	82098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015578	AGA	2	6	82148	82153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015578	CTC	2	6	82209	82214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015578	ATC	4	12	82233	82244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015578	TC	4	8	82283	82290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015578	ATAA	2	8	82353	82360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015578	GTG	2	6	82375	82380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015578	TGG	2	6	82412	82417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015578	TGGC	2	8	82420	82427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015578	TA	5	10	84640	84649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015578	TAAGAT	2	12	84658	84669	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015578	GTT	2	6	87352	87357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015578	ATA	2	6	87397	87402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015578	T	6	6	87410	87415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015578	TAT	2	6	88122	88127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015578	ATA	2	6	88883	88888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015578	TCCA	2	8	88896	88903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015578	ATG	2	6	88962	88967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015578	TTG	2	6	89015	89020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015578	TTC	2	6	89038	89043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015578	TA	3	6	89105	89110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015578	ATGCCT	2	12	89127	89138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015578	TCC	2	6	90351	90356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_015578	TAT	2	6	90383	90388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015578	AAT	2	6	90391	90396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015578	AAGG	2	8	90432	90439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015578	CATAC	2	10	100016	100025	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_015578	GTT	2	6	101261	101266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015578	TAA	2	6	101349	101354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015578	TTTC	2	8	102207	102214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015578	TTA	2	6	102263	102268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015578	T	7	7	102285	102291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015578	G	6	6	102309	102314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015578	TGA	2	6	102336	102341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_015578	CCT	2	6	102453	102458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_015578	G	6	6	102465	102470	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015578	T	8	8	102472	102479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015578	G	6	6	106682	106687	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015578	GCAGTT	2	12	106750	106761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_015578	T	6	6	106763	106768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015578	TTA	2	6	106863	106868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015578	TAT	2	6	106879	106884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015578	AT	3	6	108719	108724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015578	GAT	3	9	111659	111667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015578	ACA	2	6	111670	111675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_015578	G	21	21	114449	114469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015578	TCA	2	6	114506	114511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_015578	TAA	2	6	115437	115442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015578	TTCT	2	8	115458	115465	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
176	NC_015578	T	8	8	115494	115501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015578	AAT	2	6	115547	115552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_015578	ATT	2	6	119212	119217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_015578	TCT	2	6	119223	119228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_015578	TCA	2	6	119243	119248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_015578	TA	3	6	119279	119284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015578	TA	3	6	125166	125171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015578	TCG	2	6	125332	125337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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